MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018611	TGG	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018611	TA	3	6	1278	1283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018611	AAG	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018611	GAT	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018611	AGT	2	6	1465	1470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018611	G	7	7	1478	1484	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018611	TAAA	2	8	1790	1797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018611	TAA	2	6	1799	1804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018611	TGA	2	6	3077	3082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018611	AAGTTA	2	12	3290	3301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018611	AGA	2	6	3310	3315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018611	ACA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018611	GTT	2	6	7171	7176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018611	AGG	2	6	7257	7262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018611	AT	3	6	7263	7268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018611	CCG	2	6	8649	8654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018611	A	6	6	8703	8708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018611	T	6	6	8756	8761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018611	ATGT	2	8	8779	8786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018611	ATT	2	6	8872	8877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018611	TAT	2	6	8947	8952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018611	TAA	2	6	9024	9029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018611	TAC	2	6	9045	9050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018611	AGC	2	6	9062	9067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018611	T	6	6	9134	9139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018611	AAC	2	6	9156	9161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018611	T	6	6	9194	9199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018611	CAA	2	6	9221	9226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018611	TTC	2	6	9237	9242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018611	GTA	2	6	9260	9265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018611	AATT	2	8	9329	9336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018611	CCA	2	6	9397	9402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018611	TTG	2	6	9424	9429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018611	TA	3	6	9479	9484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018611	T	7	7	9504	9510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018611	TTA	2	6	13586	13591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018611	TA	3	6	13605	13610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018611	GAAC	2	8	13645	13652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018611	TAA	2	6	13793	13798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018611	AAT	2	6	13806	13811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018611	ATT	2	6	13840	13845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018611	T	8	8	13844	13851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018611	CAA	2	6	13870	13875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018611	AGT	2	6	14093	14098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018611	TGCT	2	8	14194	14201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018611	AGG	2	6	14211	14216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018611	A	6	6	15305	15310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018611	T	7	7	15344	15350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018611	GAA	2	6	16024	16029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018611	A	6	6	16028	16033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018611	AT	3	6	16057	16062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018611	AG	3	6	16072	16077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018611	AGG	2	6	16176	16181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018611	CATTT	2	10	17396	17405	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018611	TTA	2	6	17434	17439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018611	GAA	2	6	17467	17472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018611	CAA	2	6	17481	17486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018611	A	6	6	17530	17535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018611	TTA	2	6	18498	18503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018611	ATG	2	6	18512	18517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018611	CAA	2	6	18539	18544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018611	TAA	2	6	18557	18562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018611	A	6	6	18567	18572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018611	TAT	2	6	18584	18589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018611	AAAT	2	8	18603	18610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018611	TTAT	2	8	18622	18629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018611	GATA	2	8	18641	18648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018611	GA	3	6	18804	18809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018611	ATG	2	6	18848	18853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018611	ATC	2	6	18917	18922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018611	A	6	6	18983	18988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018611	TAA	2	6	19012	19017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018611	AAT	2	6	19028	19033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018611	TAA	2	6	19047	19052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018611	TCA	2	6	19054	19059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018611	ATT	2	6	19069	19074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018611	TTC	2	6	19108	19113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018611	A	6	6	19175	19180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018611	AG	3	6	19235	19240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018611	AGG	2	6	19339	19344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018611	CATTT	2	10	20559	20568	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018611	AAT	2	6	20593	20598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018611	TAT	3	9	20618	20626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018611	ATT	2	6	20639	20644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018611	TAG	2	6	20687	20692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018611	AAT	2	6	20698	20703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018611	TA	3	6	20716	20721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018611	TATT	2	8	20734	20741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018611	AAAT	2	8	20742	20749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018611	GAA	2	6	20805	20810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018611	TA	4	8	21778	21785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018611	T	6	6	21788	21793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018611	GGA	2	6	21794	21799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018611	GATAT	2	10	23451	23460	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018611	GAG	2	6	24958	24963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018611	GCTAC	2	10	26662	26671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_018611	CAT	2	6	26686	26691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018611	AGTA	2	8	26836	26843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018611	TTAGA	2	10	26989	26998	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018611	TAA	2	6	27061	27066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018611	GGTG	2	8	27094	27101	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018611	ATA	2	6	27126	27131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018611	TTCT	2	8	27171	27178	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018611	ACTT	2	8	27190	27197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018611	A	6	6	27245	27250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018611	GTA	2	6	27311	27316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018611	TAA	2	6	27365	27370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018611	AAG	2	6	28541	28546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018611	CCA	2	6	28566	28571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018611	ATA	2	6	28587	28592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018611	GCA	2	6	28593	28598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018611	A	6	6	28598	28603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018611	CA	3	6	28633	28638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018611	GAT	2	6	28696	28701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018611	ATA	2	6	28706	28711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018611	ATTG	2	8	28721	28728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018611	A	7	7	28743	28749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018611	CTT	2	6	28827	28832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018611	TGA	2	6	28871	28876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018611	GTTA	2	8	28895	28902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018611	AAT	2	6	29380	29385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018611	TAAT	2	8	29451	29458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018611	TGC	2	6	29472	29477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018611	ATTT	2	8	29522	29529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018611	GTAT	2	8	30685	30692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018611	A	6	6	30760	30765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018611	T	6	6	30772	30777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018611	ACA	2	6	30851	30856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018611	ATT	2	6	30867	30872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018611	TA	3	6	30932	30937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018611	T	6	6	31948	31953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018611	AATG	2	8	32001	32008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018611	TTAA	2	8	32073	32080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018611	TTA	2	6	32100	32105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018611	TTA	2	6	32157	32162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018611	TCCT	2	8	32196	32203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018611	TA	3	6	32206	32211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018611	A	6	6	32256	32261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018611	AAATG	2	10	32287	32296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018611	ATA	2	6	32308	32313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018611	A	6	6	33062	33067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018611	TA	3	6	33202	33207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018611	CCT	2	6	34377	34382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_018611	AT	3	6	34507	34512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018611	AG	3	6	34711	34716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018611	ATC	2	6	34731	34736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018611	TC	3	6	34735	34740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018611	AGGA	2	8	34744	34751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018611	CAC	2	6	35047	35052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_018611	TTA	2	6	35935	35940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018611	ATTT	2	8	35954	35961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018611	ATT	2	6	38536	38541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018611	TAA	2	6	38556	38561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018611	TA	4	8	38564	38571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018611	GTG	2	6	38585	38590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018611	A	6	6	38606	38611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018611	A	6	6	38618	38623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018611	T	6	6	38674	38679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018611	TAAG	2	8	38727	38734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018611	ATT	2	6	39362	39367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018611	TAA	2	6	39387	39392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018611	TA	3	6	39443	39448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018611	TCA	2	6	39533	39538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_018611	T	7	7	39573	39579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018611	CAT	3	9	39612	39620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_018611	TAGT	2	8	39687	39694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018611	GAT	2	6	39708	39713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018611	TAA	2	6	39724	39729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_018611	TCT	2	6	39762	39767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_018611	AAT	2	6	39772	39777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018611	CAA	2	6	39834	39839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_018611	TAAT	2	8	39950	39957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018611	GTT	2	6	40872	40877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018611	AATC	2	8	40926	40933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_018611	ATA	2	6	40943	40948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018611	GAA	2	6	40949	40954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_018611	T	7	7	41083	41089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_018611	TAA	2	6	41666	41671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_018611	ATT	2	6	41676	41681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_018611	TTA	2	6	41741	41746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_018611	A	6	6	41752	41757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018611	CAC	2	6	41759	41764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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184	NC_018611	TA	3	6	41790	41795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018611	CAA	2	6	41864	41869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_018611	AAT	2	6	41908	41913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_018611	TTCAG	2	10	41918	41927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
188	NC_018611	AGA	2	6	41933	41938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_018611	ACT	2	6	43152	43157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_018611	A	7	7	43265	43271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_018611	CTT	2	6	43291	43296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_018611	ATT	2	6	43321	43326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_018611	CCT	2	6	44692	44697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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197	NC_018611	GAT	2	6	44724	44729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NC_018611	TAAT	2	8	44752	44759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_018611	TAT	2	6	46998	47003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_018611	GGTT	2	8	47018	47025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
201	NC_018611	TGG	2	6	47055	47060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_018611	CA	3	6	54855	54860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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247	NC_018611	ATG	2	6	56359	56364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_018611	CT	3	6	56427	56432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.